SepsiTest BLAST

Übersicht

SepsiTest™ BLAST ist ein Webtool für die schnelle und zuverlässige Klassifizierung von (partiellen) SSU rRNA-Gen-Sequenzen. Schwerpunkt der Anwendung ist die Identifizierung von Krankheitserregern, SepsiTest™ BLAST kann aber ebenso für andere Untersuchungsgegenstände genutzt werden.

Die folgende Abbildung fasst die Funktionsweise und den Funktionsumfang von SepsiTest™ BLAST zusammen:

Ziel ist es, dem Nutzer im Vergleich zu den Standard-Webtools für die ähnlichkeitsbasierte Identifizierung von DNA-Sequenzen wie NCBI-BLAST ein wesentlich schnelleres und zweckmä├čigeres Werkzeug anzubieten, das insbesondere auch die Bewertung der Ergebnisse erleichtert.
Mit Hilfe von optimierten Filterkriterien wird zunächst die ähnlichste Sequenz in einem qualitativ hochwertigen Referenzdatensatz ausgegeben mit vollständigem Artnamen, übergeordneter Familie und Link zu dem Originaleintrag in den öffentlichen Datenbanken. Bei Bedarf kann eine erweiterte Liste mit zusätzlichen Treffern angezeigt werden.

SepsiTest™ BLAST ist zugeschnitten auf Routineanwendungen, die verlässliche Ergebnisse basierend auf hochwertigen Referenzdaten benötigen, ohne dass in der Durchführung unnötige Reibungsverluste durch eine eingeschränkte Gebrauchstauglichkeit der verwendeten Werkzeuge entstehen.

SepsiTest™ BLAST ist keine "black box"! Der Inhalt der Referenzdatenbank ist vollständig transparent und entspricht höchsten wissenschaftlichen Standards.

Weitere Informationen sowie Beispiele finden Sie in unseren FAQs ...